毎日発生するShopifyの注文データを、freee会計へ勘定科目・取引先・メモタグ・部門・品目を指定して自動で連携することができます。注文をfreee会計へ連携するにあたって、決済手数料や送料、消費税、割引などにそれぞれ別の勘定科目を指定してfreee会計へ記帳することも可能なうえ、「記帳しない」「商品の勘定科目と合わせる」設定にもできます。POSへの対応も可能となっています。Shopifyペイメントの決済手数料を記帳することができるので、freee会計へ記帳された未決済取引の消込もスムーズに行うことができます。freee会計への連携を自動に設定した場合、毎日自動でfreee会計への連携を実行します。手動で注文の発生した期間を指定して連携をすることも可能です。また、freee会計で一度削除したデータも「強制記帳」で再連携することができます。さらに、Shopifyの商品在庫を棚卸として記帳することを支援するための棚卸処理機能も用意しています。